logo

Deteksjon og prediksjon av sykdomsspredning

Tildlig deteksjon og modellering av hvordan sykdommer spres er viktig for helsetjenesten og beslutningstakere.

Bakgrunn

Smittsomme sykdommer er en betydelig belastning for helsetjenesten. Ved å tidligere oppdage et utbrudd og modellere hvordan det spres kan ressurser tilrettelegges og smittespredningen begrenses.

Mål

Å utvikle statistiske teknikker for å detektere nye sykdomsutbrudd og å modellere spredning basert på spatio-temporale data.

Metoder

Tidsserier, ikkeparametriske glattingsteknikker og flerskalateknikker ble brukt for å analysere data. Deteksjon oppnås ved c-SiZer som er en flerskalateknikk for å detektere endringer i tidsserier der endringsraten ikke er kjent på forhånd. Spredning modelleres både ved Gaussiske Markovfelt (GMRF) og såkalte "power laws".

Samarbeidspartnere

  • Fred Godtlibsen, UiT
  • Johan Gustav Bellika, NST
  • Marc Geilhufe, UiT
  • Håvard Rue, NTNU, Trondheim
  • Leonhard Held, University of Zürich, Sveits

Publikasjoner

  • Geilhufe, Marc. "Statistical Analysis of Lattice Data with Wavelet Variance Methods and Spatiotemporal Modeling of Infectious Disease Spread." PhD Thesis. (2013).
  • Geilhufe, Marc, Held, Leonhard; Skrøvseth, Stein Olav; Simonsen, Gunnar Skov; Godtliebsen, Fred. "Power law approximations of movement network data for modeling infectious disease spread." Biometrical Journal 56.3 (2014): 363-382.
  • Yigzaw, Kassaye Yitbarek, and Johan Gustav Bellika. "A communicable disease prediction benchmarking platform." Biomedical and Health Informatics (BHI), 2014 IEEE-EMBS International Conference on. IEEE, 2014.
  • Skrøvseth, Stein Olav; Godtliebsen, Fred; Bellika, Johan Gustav. Causality in Scale Space as an Approach to Change Detection. PLoS ONE 2012 ;7(12) e52253.
  • Geilhufe, Marc; Skrøvseth, Stein Olav; Sørbye, Sigrunn Holbek; Yigzaw, Kassaye Yitbarek; Bellika, Johan Gustav; Godtliebsen, Fred. Spatio-temporal modeling of communicable diseases: A case study of North Norway. The Second Workshop on Bayesian Inference for Latent Gaussian Models with Applications, Trondheim, Norway, 2012.
  • Skrøvseth, Stein Olav; Geilhufe, Marc; Yigzaw, Kassaye Yitbarek; Simonsen, Gunnar Skov; Bellika, Johan Gustav; Godtliebsen, Fred. Modeling the spread of infectious diseases by Gaussian Markov Random Fields as a tool for medical decision making. 14th biennial SMDM European meeting, Oslo, Norway, 2012.
  • Geilhufe, Marc; Skrøvseth, Stein Olav; Godtliebsen, Fred. Spatio-temporal modeling and outbreak detection of infectious diseases in northern Norway. 3rd Nordic-Baltic Biometric Conference, Turku, Finland, 2011.
  • Geilhufe, Marc; Skrøvseth, Stein Olav; Godtliebsen, Fred. Spatio-temporal Modelling and Outbreak Detection of Infectious Diseases in Northern Norway. InFER2011 (Inference For Epidemic-related Risk), Warwick, UK, 2011.